De nouvelles combinaisons thérapeutiques anti-VIH pourraient prévenir la fuite et le rebond viraux : une approche informatisée pourrait aider les cliniciens à sélectionner les meilleures combinaisons d’anticorps largement neutralisants pour traiter le VIH en fonction de la génétique du virus

L’étude montre que les approches informatiques pour sélectionner des combinaisons de bNAbs basées sur la génétique virale pourraient aider à prévenir l’évasion virale, rendant le traitement du VIH plus efficace.Il peut également offrir une stratégie pour concevoir des combinaisons efficaces de bNAbs pour traiter d’autres agents pathogènes en évolution rapide.

bNAbs offre un nouvel outil prometteur pour traiter ou potentiellement guérir les infections par des virus à évolution rapide tels que le VIH. Des essais cliniques utilisant un seul bNAb pour traiter le VIH ont montré que certaines souches virales peuvent survivre au traitement et entraîner un rebond des virus dans le sang. Les combinaisons de bNAbs peuvent donc être une approche plus efficace, mais trouver les meilleures combinaisons est un défi.

“Pour notre étude, nous avons proposé d’utiliser une approche informatique pour prédire l’efficacité des combinaisons bNAb basées sur la génétique du VIH”, explique Colin LaMont, chercheur à l’Institut Max Planck pour la dynamique et l’auto-organisation à Göttingen, en Allemagne.

LaMont et ses collègues ont utilisé le séquençage à haut débit pour analyser la génétique des virus VIH recueillis sur 10 ans chez 11 patients séropositifs non traités.L’équipe a utilisé ces données pour prédire quelles souches virales pourraient échapper au traitement avec différents bNAbs et si l’esquive des bNAbs était associée à un coût de survie. Ensuite, en utilisant des méthodes informatiques, ils ont appliqué les connaissances acquises pour prédire les rebonds viraux dans trois essais réels de bNAbs.

Enfin, l’équipe a utilisé son approche informatique pour trouver une combinaison de bNAbs qui est la moins susceptible de permettre à un virus de s’échapper. Ils ont également constaté que certains bNAb, tels que 10-1074, sont meilleurs contre diverses populations de virus parce que les mutations qui permettent aux virus de s’échapper rendent également le virus moins susceptible de survivre. D’autres, y compris PGT121, sont plus efficaces contre des populations virales moins diversifiées parce que les mutations qui permettent de s’échapper sont rares. Dans l’ensemble, les résultats suggèrent que la combinaison optimale comprend trois bNAb: PG9, PGT151 et VRC01.

“Nous avons montré que la combinaison de PG9, PGT151 et VRC01 réduit le risque de rebond viral à moins de 1%”, explique LaMont.”Il le fait en ciblant trois régions différentes de l’enveloppe extérieure protectrice du virus.”

“La combinaison de bNAbs, administrés par perfusion intraveineuse tous les quelques mois, avec les thérapies antirétrovirales (TAR) actuelles qui nécessitent des doses quotidiennes pourrait encore améliorer le succès à long terme du traitement du VIH”, suggère l’auteur principal Armita Nourmohammad, professeur adjoint au Département de physique de l’Université de Washington, Seattle.

Le TAR réduit la capacité du VIH à se multiplier et à créer de nouveaux variants, ce qui limite la diversité génétique de la population virale et réduit la probabilité d’émergence de variants d’échappement bNAb. Les auteurs disent que d’autres études sont nécessaires pour confirmer les avantages potentiels de la combinaison du TAR et des bNAb.

“Notre étude montre que l’exploitation des données génétiques peut nous aider à concevoir des thérapies anti-VIH plus efficaces”, conclut Nourmohammad. “Notre approche peut également être utile pour concevoir des thérapies contre d’autres agents en évolution rapide qui causent des maladies, tels que le virus de l’hépatite C, les bactéries résistantes aux médicaments ou les cellules tumorales cancéreuses.”

Source de l’histoire :

Matériaux fournis par eLife. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

Référence de la revue:

1. Colin LaMont, Jakub Otwinowski, Kanika Vanshylla, Henning Gruell, Florian Klein, Armita Nourmohammad. Conception d’une polythérapie optimale avec des anticorps largement neutralisants pour supprimer le VIH-1. eLife, 2022; 11 DOI: 10.7554/eLife.76004